Пацієнту пропонують спрей для місцевої анестезії, щоб знеболити горло, та/або заспокійливий засіб, який допоможе розслабитися.
Іноді процедуру необхідно проводити під загальним наркозом.
Людину попросять лягти на лівий бік, після чого в рот помістять пластикову капу, щоб тримати його відкритим. Ендоскоп буде введений через рот в горло. І лікар попросить зробити ковтальний рух.
Спочатку це може викликати дискомфорт і блювоту, але це почуття зменшується в міру просування ендоскопа вниз по стравоходу.
Повітря нагнітається в шлунок, щоб лікар міг отримати чітке зображення. Це може викликати здуття живота або відрижку, але даний стан виникає на короткий період і зникає після завершення гастроскопії.
Біопсію можна взяти за допомогою крихітних хірургічних інструментів, через трубку. Певні стани, такі як кровоточива виразка шлунку, розширені вени або звужений стравохід, можна лікувати під час процедури.